接續前文的時序性研究發想:結構性思維

上週介紹了時序性思維的應用與限制,也看到時序性思維在歸因與組織證據時論點過於單薄的問題,本週便要介紹增厚論點的關鍵思維方式—地利,結構性思維


地利:結構性思維

結構性思維有個 “構” 字,專注於當下時空斷面中的組成要素。換言之,關注當下發生的事情中,各項參與因素的狀況,包含以下三點:

  • 事件是由何種要素組成的?
  • 組成要素間的強弱關係
  • 要素間的交互作用

結構型思維用全局的角度來觀察單一時空斷面下的各要素,各要素可能交互影響這個事件 (像是金木水火土的相生克),也可能完全無關 (方向是由東西南北的命名組成,為何稱”東”純粹是定義問題)。

在全局的角度下,各要素可以是同時存在的,可能上下(包含與被包含)與平行的關係,但不像時序性有先後的關係。透過歸納這些關係,結構性思維達成他的使命。

結構性思維割捨時間進程,專注於將各要素分離出來進行討論,希望能獲得高純度的事件影響要素

以結構性思維發展出的問題類型

  • 這個要素真的與該事件有關?
  • 這兩個因素誰比較重要?是否有交互作用?
  • 兩因素的恰當比例為何?是否能改變因素來達到更佳的事件結果?
  • 我們是否考慮到整體框架下的各變因?該因素在此條件下能否代表結構的整個面向?或是僅為一面向中的一例子?

此類型的問題套用在生物學與化學上的應用則多屬於 方法優化型 的問題,各舉一個例子:

結構性思維善於製造分析問題的框架,舉幾個常見的例子:

如何以結構性思維 發展研究題目

針對這種類型的問題,我們可以以當前課題為基準,由差異上下、平行三種方向來發展題目,介紹如下

差異:兩物間的要素差異

透過比較兩試驗、兩現象間,造成其結果的要素差異來推測後續可做的點,是最簡單的發想方向,在除錯時最常用到。

舉例而言,桌上有兩杯水,一杯鹹一杯無味。我根據常識判斷,鹹味是造成兩杯水味道最主要差異的原因,而鹹味物質是造成鹹味的主要因素。於是,我接下來便有個研究題目:檢測鹹水中是否有食鹽存在

上下:要素間的隸屬關係

透過掌握要素間的相互隸屬關係,我們能逐步探詢可用的研究方向

母子集合的變化得失

掌握其母集合與子集合的變化得失是個方向。比如我發現K蛋白會讓小鼠大量產生Y代謝物,且K蛋白屬於A家族且具有bHLH結構。或許A家族的蛋白質、有bHLH結構的蛋白質,兩者皆有的蛋白質我都能拿來試試看是否會造成Y代謝物的變化,可用來對結果做更廣泛的詮釋

因子強弱造成的上下關係變化

探討集合中各項因素強弱,造成上下關係變化也是一招。同樣的K蛋白質與Y代謝物的例子,大量的Y代謝物是否會產生負回饋,抑制K蛋白質的產量或活性?

平行:交互作用、最佳解、潛在未知

專注於各項平行因素是最常見的結構性思維,一般而言有以下三種發展方式

交互作用

各項平行因素是如何交互作用的? 比方木火土都存在時,是木去克土還是木生火生土?各項因素的強弱是否會影響關係的成立?

最佳解

是否有一個各因素的最佳強弱、比例可得到最佳的事件結果? 比方說微生物培養生產代謝物,需要考慮碳、氮、鹽等物質的濃度與比例,鹽類濃度過高會影響蛋白態氮元素的溶解與吸收,鹽類濃度過低又會造成營養失調,是否有一個能夠兼顧營養供給與生產代謝物的配方?

潛在未知

最有意思的一項當屬於兩項平行因素間,是否會直接或間接的產生時序性(先後或因果)或未被發現的上下階層(包含或被包含)關係。比方說我們發現A、B兩蛋白質會平行的參與在某個發炎反應,在反應中互不相干涉,若是我們發現A反應後會產生C,C會造成廣泛的影響(包括B),這就屬於時序性(因果)的發現。若是透過序列比對發現A、B共屬於某一蛋白質家族、或是A屬於B蛋白家族中的一種分支,這都屬於未被發現的上下關係

結構性思維的限制

結構性思維固然強大,但也有其侷限性:

因素窮舉的難處

結構性思維的要素需要窮舉,被遺漏的因素無法對結構分析產生貢獻,這是結構思維最大的短處。

時序性思維尚可用因果關係串聯各要素,降低要素被遺漏的可能。結構思維缺乏因果關係的支持,很難將各要素間的關係做連結與捉漏。

因此,善用結構思維最重要的一點,就是盡量完善對結構中因素的窮舉能力,考驗著思考著思維的全面度、緊密度與對背景的熟悉度,新發現的因素也會對舊的結構產生巨大衝擊。關於結構思維缺角的結果,可參見[Case study] 2. —我相信菌只會做B物質

時序性、連續因素處理困難

開篇有提到結構性思維主要是在單一時空斷面下,處理該瞬間的斷面中各要素交互作用的思維模式。

但如果該要素隨著時間變遷下,雖然具有相同的要素組成,卻會導致不同結果;系統性、週期性產生的歷史現象也處理得不好。對於前所未見的劃時代現象也預測困難

承以上兩點,結構性思維亦須搭配時序性思維使用,才能互補有無


結構性思維可以縱貫整個研究,包括以下方面:

ChatGPT 對結構性思維展開的影響(2023.10.23)

前述提到結構性思維的一大限制就是因素窮舉有困難,而且相當依賴領域知識

使用ChatGPT可以大幅改善這個問題,已有許多在本質上屬於結構性思維的思考框架,被當作prompt 餵給ChatGPT 使用並取得不錯的成效

目前看到的有5W2H, 六頂思考帽等族繁不及備載,使用的敘述也很簡單,例如 請用六頂思考帽法回覆某某問題 之類的,完全沒有進入門檻

可以說思考框架類的列舉已經不是最重要的事了,取而代之的是有辦法評估ChatGPT 列出來的事物為真、具備關聯性的能力,以及對於結構性思維本質上的理解