最近和J同事討論到實驗記錄的問題

J覺得實驗記錄是相當重要的事情,不過許多人常不確定該記甚麼東西,容易導致漏記一些事情而必須重作實驗,對於研究生來說是一大時間殺手

詳細的實驗報告文字寫法,其實台大莊榮輝教授的實驗室網頁有相當鉅細靡遺的敘述,我覺得按表操課已經相當足夠。[點這裡]

這篇我想寫的主要是如何利用一些圖表,迅速記錄、整理起自己曾經做過的事情,不會像實驗記錄本那樣鉅細靡遺,但是要作大方向觀測和除錯時能一目了然的工具

用圖表整理實驗數據的重要性

一句話,知道自己幹過甚麼事,好處如下:

  • 可以避免又掉到坑裡或是多作無謂的事
  • 知道自己缺了甚麼方向,或是過度集中在某個方向 (見樹不見林)
  • 方便自己debug,尤其是日常等級的實驗出問題時,實驗記錄是除錯相當關鍵的因素
  • 降低我們指導新人的時間成本,還有 “售後服務” 的機率
  • 非常方便寫論文,圖表都畫好了,圖說也寫得差不多了,reference也列好了

以下講講我在整理實驗時會用到的四種方式:大流程圖、實驗設計表、SOP流程圖、結果呈現圖表

戰略:大流程圖

這種圖在演算法開發上是很普通的工具,拿來實驗規劃用剛剛好,大流程圖天生就屬於戰略層面規劃的工具

  1. 最一開始由你的論述基底開始 (base),然後逐步向旁邊衍生出規劃的方向 (ex. 圖中的實驗方向1)、支持他的實驗(ex. 圖中的實驗2-2) 等
  2. 再用不同的符號補上自己曾作過的失敗的嘗試、調整過的策略、作出來結果的正負向 (支持、反對這個base的箭號)
  3. 這樣對於自己曾作過的方向和結果都能一目了然
  • 擅長:前期規劃實驗方向、後期收官整合更動、寫論文時拿來畫實驗架構圖

畫流程圖的工具我會推visual paradigm,純粹是因為比較喜歡他的用法,可以考慮到template city找自己喜歡的 (去看參考資源區吧)


大流程圖再往下細分到戰術層面,就是每個實驗要作甚麼事情,這可以分成實驗前中後三個部分,分別由實驗設計表、SOP流程圖、結果呈現圖表來擔當

實驗前:實驗設計表

需要材料:

  1. 為何要做這件事:請填入你作這個實驗的原因 << 防止你作無意義或半調子的事情
  2. 表格內容:自己填入你想作的實驗設計 << 基本素材
  3. 改這些參數的原因:請填入你為甚麼想觀察A、B、C? 而不是D的原因或reference << 強迫你想
  4. 這個參數這樣調的原因:請填入你為甚麼想把A調成A1、A2、A3? 而不是A4的原因或reference <<強迫你想
  5. 下面的實驗組數:提醒你後續備料和操作時確認數量不要作錯

擅長:小實驗設計、進度報告

  • “大致上的實驗設計” 我會列在旁邊,檢索時比較快進入狀況不用重讀
  • 強烈建議附上參考文獻,這樣以後要寫論文/defense都相當方便

實驗中:SOP流程圖

需要材料:

  1. 實驗作法的SOP本身,關於怎麼建立自己的SOP請看先前提過的文章,[研究生日常] — 寫好自己的武功秘笈! 詳解如何撰寫良好的實驗步驟SOP
  2. 材料:備料用
  3. 時間:排程用
  4. 查核點:檢視自己實驗是否有問題的點
  5. 停止點:可以停下來做其他事情的點,排程用

擅長:除錯、實驗進行、結果對比、傳承

實驗後:結果呈現圖表

基本上就是就是show 你的圖表結果,這邊因實驗性質差異太大就不放圖了,提一下最好放上的材料:

  1. 做過的更動、發生的意外 (反正就是跟實際操作上不同的地方),
  2. 小結、假設:讓自己大概知道這張要講啥
  3. 檢討、其他意見:主要是除錯心得
  4. 後續做法:整理好起承轉合

提幾個建議:

  • 可以的話,盡量附上簡單的實驗設計解釋(把實驗設計表的表格部分移過去就行了)
  • 如果是一系列的實驗 (比方說測試發炎因子1、2、3 然後想拿這三個證據來共同支持有發炎),可以參考one-page-show 的形式,盡量將所有結果放在同一張

這些整理方式和作圖並沒有說相當複雜、需要專業美工,重點是呈現的邏輯清晰,理應不會花到太多時間,只要在自己規劃時就記個大概的框架,剩下部分在實驗空檔把他補齊就相當足夠了。