最近關心一下學弟妹的狀況，發現碩一的學妹C對於畢業相當焦慮，Let’s see the dialogue：
- C：學長我挺焦慮的，很擔心自己的研究進度是不是落後，也不確定自己題目的大目標，以及做出來的東西能不能讓我準時畢業
- 我：說說你現在在作甚麼
- C：我現在養了A菌，然後我感染了植物K幾盤，下禮拜要再做幾盤…..
- 我：恩，停一下，所以你為甚麼要養A菌?
- C：養A菌可以感染植物，將基因E, F, G, H, I 等轉殖入植物體內，讓植物可以表現蛋白質E, F, G, H, I ，然後就可以影響植物K的P物質的產量
- 我：很好，清楚的多。
hint of this part： 明確定義 aim，有利於整理思考和意思傳達，是解決問題的第一步："問題辨識"。
閱讀清單：
- [研究所meeting] — 口頭報告好緊張？ 3步驟教你如何有條理、有架構地組織1分鐘短講
- [研究所meeting] — meeting 好可怕？ 如何用SCQA框架簡單有效的做好meeting 進度報告
- [思維框架] — 你的論述有根據嗎？ 如何用連續QA法找到論述的基底 (base)
我們繼續對話：
- 我：所以植物K中完全沒有基因E, F, G, H, I? 你全部都要自己基因轉殖進去?
- C：確實沒有基因E, F, G, H, I，但是我只負責轉入基因E。
- 我：所以用一句話來說，大計畫是想 “影響植物中P物質的產量”，透過 “表現蛋白質E, F, G, H, I ” 來完成，但是你只負責 “表現蛋白質E” 的部分對吧?
- C：是的
- 我：明確目標後，可以首先知道的是，你需要多個題目同時進行，對你的畢業比較安全
- C：為甚麼?
- 我：我覺得有幾個原因
- 轉殖表現這件事情本來就曠日廢時，你能夠失敗錯誤的次數並不多。
- 你只有單一一個標的基因E，如果他出現奇怪的狀況如lethal、排斥等，你會很不好做。
- 這個題目基本上只能一條路圍繞著基因E作到底，轉殖失敗甚麼都不能做，也無法用基因E轉去其他研究方向。
- 若是蛋白質E, F, G, H, I全做了就相當具有價值，但是用A菌來轉殖基因的技術已相當成熟，學界會認為E基因的轉殖成功是應該的，失敗是難以解釋的
- 即便作成了，能寫的數據和討論都相當單薄，無法討論太多的生理意義，也無法衍生出更多可嘗試來支持你研究的子實驗
- 我：所以只憑當下這個實驗，你的論文會相當單薄
hint of this part： 1.實驗目標，若是不能用一句話簡單講明，那就很難有推行的價值。 2.多個題目同時進行，可以降低意外事故的風險 3.容易做的題目通常 "翻桌率高"、"學術價值高"、"可以用多種形式證明和延伸"、"可觀察的面向多" 4.人家認為理所當然的慣行實驗做不出來，會很難善後
閱讀清單：
我們繼續對話：
- C：蛤……聽起來有點可怕
- 我：那我先不提新題目這件事情，你當下題目的進程也相當吃緊，我先畫一張你的實驗架構流程圖：
- 基因轉殖E準備(轉型質體建構等)
- 養可供轉型的特殊A菌細胞
- 將基因E 轉殖入A菌
- 篩選出帶有基因E的A菌
- 合格A菌感染植物K 、被感染的植物K生長 、確認基因E轉殖入植物K
- HPLC分析確認基因E的相關產物是否存在於植物K內
- 我：由於轉殖需要做出同型合子，因此粗體的部分至少必須要做兩次才能得到，實際上當然要做更多次
- 我：我們先假設你是天選之人，做實驗都100%成功率，依你現在辦的到的速度，將每個步驟需要的時間填上去
- C：(刷刷筆聲……..)，大概是這樣：
- 轉殖質體建構：一月
- 做轉殖用細胞：一週
- 基因轉入A菌：二週
- 篩出正確A菌：一月
- 感染並篩出轉殖植物：六週
- 分析代謝物含量：二月
總共為31週~八個月
- 我：這些分子生物實驗你先前是否有過經驗?
- C：只有感染有經驗，六週是植物長的時間，還是得等待
- 我：HPLC之前有用過嗎? 或是曾有認識的人抓過這個條件
- C：都沒有
- 我：那就得再加上熟悉HPLC的時間，有其他人排程的情況下兩個月我覺得是相當緊的。
- 我：八個月還是假設你都一帆風順的情況下能做到的時間，實際執行會有一卡車的問題。為了方便時間估算，我們直接用 “兩倍定律” 把耗時 8個月*2 =16個月
- C：蛤，那差不多是一年半!
- 我：而且最後一步我們只算了HPLC的代謝物分析，若想把研究做完整，酵素的活性表現、RNA表現量都是很基本要做的
- C：那個就算了吧……….鐵定來不及的
- 我：所以我說時間很趕，這還是影響植物K成功的情況下
- 我：萬一發生實驗成功研究失敗的狀況，也就是當你成功做完所有轉殖，卻發現蛋白質E跟本沒有影響植物K的能力，那會陷入進退維谷的境地
hint of this part： 1.流程圖可以幫你釐清現在的進度 2.用數字觀念可以算出你現下需要的資源 3.兩倍定律能協助你評估不確定性的耗時
閱讀清單：
- [實驗設計] — 實驗圖表好雜亂？ 如何用4種圖表從宏觀到微觀的整理與呈現實驗數據
- [思維框架] — 文章論述好空泛？ 如何用簡單的 “量化思維“ 評估抽象的研究論述
- [研究生日常] — 不知道研究會做多久？ 善用 「兩倍定律」預估實驗耗時
- [實驗排程] — 用 “產耗比” 概念簡單預估實驗備料週期
我們繼續：
- 我：所以說增加效率、努力推進度、找替代方案是當務之急
- C：具體要怎麼做?
- 我：風險分攤，要先多看文獻找到你可以在主實驗外同時進行、同時觀察的目標，並且詳實的記錄所有參數，這樣你隨時可以交叉比較或換題目
- 我：訓練自己實驗的標準化，可以同時進行多個實驗來壓縮時間
- 我：像這種篩的實驗，時間經費許可就多個篩選方式進行，目的是最快挑到你要的生物，不要一次只做一種方式
hint of this part 1.增加效率：標準化、並行，減少重作浪費 2.努力推進度：用最快速度得到結果 3.替代方案：多個方向同時觀察
閱讀清單：
發佈留言