Case 背景介紹
學弟P近日與其他實驗室合作，希望利用R1菌來分解汙染物質。根據對方實驗室的了解，R1菌的同種不同株菌R2可以製造F物質來分解該汙染源。
我剛好路過聽到同事X與學弟P的討論，便一同加入了對話，let’s see the dialogue：
- 同事X：所以你下一步打算做甚麼?
- 學弟P ：我還在思考……或許再跟學長S討論一下
- 同事X：那你有去看過R1是否會生產F物質嗎?
- (加入對話) 我：Good question，同事X
- 學弟P ：還沒，我想R1應該會生產吧
- 我、同事X：……………….
- 同事X：那學長S讓你做甚麼?
- 學弟P：採取各種不同濃度的培養液培養R1菌，看R1菌生產F物質的效果
- 同事X：不對，你應該先用儀器檢測R1菌會不會生產F物質
- 我：學弟P跟同事X都不完全對—
Case 的問題所在
我們根據學弟P的敘述來搭建此案例的基底結構圖：
- R2菌會生產F物質 (R2菌的基底)
- F物質可以分解汙染物 (F物質的基底)
- R2菌分解汙染物的方式包含利用F物質 (R2+F的一層推論)
- R1菌應該會和R2菌有一樣或類似的方式 (R1菌的基底)
- 生產F物質
- 利用F物質分解污染
- 承4，R1菌能分解汙染 (R1菌的一層推論)
- 所以我們應該討論不同培養狀態下，R1菌分解汙染的能力 (主論述)
可以看出3, 4, 5其實都有待檢視，舉幾個例子：
- 3：R2有其他分解汙染方式?
- 4：R1跟R2可以類比是個需要檢定的假設，是否正確都未知，拿來做基底很危險
- 5：建立在危險基底(4)之上的推論就更危險了
學弟P並未檢視論述成立的前提，貿然往後續實驗做很容易出現失誤，前車之鑑：
同事X的論述確實有補齊4-1的部分，但還需要考量4-2及5。
Let’s continue the dialogue：
- 我：(如上解釋)
- 同事X：確實還需要顧慮到其他分解汙染的可能性，那你打算如何測F物質?
- 學弟P：直接拿培養液來跑HPLC吧
- 同事X：他不需要萃取???
- 學弟P：我不確定，我再查查幾篇文獻
- 同事X：培養液成分那麼複雜，多半是要萃取才能有效偵測的。你還必須比較不同方法的萃取效率，才能挑選出恰當的方法，這是你的當務之急
- 學弟P：喔喔，好喔
- 我：我補充一點，我覺得在檢視萃取效率之前，有件更重要的事情要先做…
萃取效率是比較用兩方法萃取等量物質後，有多少含量的物質被成功萃取，本質上屬於兩定量實驗的比較，因此在實施前須確認其基底是否完善。
我們看看萃取效率的基底結構：
- 專一性、可檢測、重複性 (定性基底)
- 定性
- 儀器與濃度的關係，此關係可維持的範圍，即線性關係與線性區間 (定量基底)
- 定量 (基底為2,3)
- 定量實驗的比較 (4的一層推論)
使用標準品：縮減討論範圍到 “檢測F物質的能力”，排除掉R1菌的變數
外標法：穩固1, 2 , 3的敘述
內標法：穩固1 的敘述，並且能透過其他物質的正確訊號呈現，排除5m1e中有問題的可能性。
Case的後續發展與啟示
我：F物質的標準品與標準分析方法要自己先確立，並用其他物質做內標準品，詳見以下：
- 外標法：拿標準品配置系列濃度施打標準曲線，觀察重複性、可檢測性與線性區間
- 內標法：同管柱、相同流洗條件可一同添加的物質做內標準品，可一次排除5m1e中的所有問題
關於評估良好分析方法的幾個要素，之後也會以文章闡述
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